尽管优势突出，但FO技术，特别是中空纤维FO膜，也面临严峻挑战：

内浓差极化： 这是FO性能的“头号杀手”。

机理：在多孔支撑层内部，被截留的溶质会累积（浓缩极化），或渗透进来的汲取液被迅速稀释（稀释极化），严重削弱有效的渗透压驱动力，导致实际水通量远低于理论值。

中空纤维的挑战：由于其纤细的结构和弯曲的流道，ICP效应比平板膜更为显著，对膜结构设计提出了极高要求。

汲取液的选择与再生：

理想汲取液需要具备高溶解度（产生高渗透压）、易于与水分分离、无毒、成本低等特性。

汲取液再生是系统主要能耗来源，如何低成本、高效地再生汲取液是FO技术商业化的核心瓶颈。

膜材料与结构的优化：

需要开发超薄、高孔隙率、亲水性的支撑层以减轻ICP，同时保证膜的机械强度。

中空纤维膜的纺丝和封装工艺比平板膜更复杂，质量控制难度大。

系统设计与成本：

整个系统（FO单元+汲取液再生单元）比单一的RO系统更复杂，初始投资成本可能更高。